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Enregistrement W1996679509 · doi:10.1002/jso.20214

Gastric cancer: New genetic developments

2005· article· en· W1996679509 sur OpenAlexaff
Henry T. Lynch, William M. Grady, Gianpaolo Suriano, David G. Huntsman

Notice bibliographique

RevueJournal of Surgical Oncology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineCancerEtiologyGermline mutationHelicobacter pyloriPopulationCDH1Incidence (geometry)GeneticsGastroenterologyPathologyMutationInternal medicineGeneBiologyEnvironmental healthCadherin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gastric cancer's (GC) incidence shows large geographic differences worldwide with the lowest rates occurring in most Western industrialized countries including the United States and the United Kingdom; in contrast, relatively high rates of GC occur in Japan, Korea, China, and South America, particularly Chile. The Laurén classification system classifies GC under two major histopathological variants: 1) an intestinal type and 2) a diffuse type. The intestinal type is more common in the general population, more likely to be sporadic and related to environmental factors such as diet, particularly salted fish and meat as well as smoked foods, cigarette smoking, and alcohol use. It exhibits components of glandular, solid, or intestinal architecture, as well as tubular structures. On the other hand, the diffuse type is more likely to have a primary genetic etiology, a subset of which, known as hereditary diffuse gastric cancer (HDGC), is due to the E-cadherin (CDH1) germline mutation. The diffuse type pathology is characterized by poorly cohesive clusters of cells which infiltrate the gastric wall, leading to its widespread thickening and rigidity of the gastric wall, known as linitis plastica. Helicobacter pylori infection is associated with risk for both the intestinal and diffuse varieties of gastric cancer. Germline truncating mutations of the CDH1 gene, which codes for the E-cadherin protein, were initially identified in three Maori families from New Zealand that were predisposed to diffuse GC. Since then, similar mutations have been described in more than 40 additional HDGC families of diverse ethnic backgrounds. It is noteworthy that two-thirds of HDGC families reported to date have proved negative for the CDH1 germline mutation. A number of candidate genes have been identified through analysis of the molecular biology of E-cadherin. Patients with evidence of the CDH1 germline mutation in the context of a family history of HDGC must be considered as candidates for prophylactic gastrectomy, given the extreme difficulty in its early diagnosis and its exceedingly poor prognosis when there is regional or distant spread. Specifically, the E-cadherin cytoplasmic tail interacts with catenins, assembling the cell-adhesion complex involved with E-cadherin mediated cell:cell adhesion. Beta-catenin and gamma-catenin compete for the same binding site on the E-cadherin cytoplasmic tail, directly linking the adhesion complex to the cytoskeleton through alpha-catenin. Beta-catenin gene (CTNNB1) mutations have been described predominantly in intestinal-type gastric cancers and CTNNB1 gene amplification and overexpression have recently been described in a mixed-type gastric cancer. This paper reviews the genetics of both intestinal and diffuse types of gastric carcinoma, their differential diagnosis, molecular genetics, pathology, and, when known, their mode of genetic transmission within families.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations220
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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