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Enregistrement W1996880932 · doi:10.1366/13-07047

The Identification and Differentiation of Secondary Colorectal Cancer in Human Liver Tissue Using X-ray Fluorescence, Coherent Scatter Spectroscopy, and Multivariate Analysis

2014· article· en· W1996880932 sur OpenAlexaff
Sahar Darvish‐Molla, Alia Al‐Ebraheem, Michael Farquharson

Notice bibliographique

RevueApplied Spectroscopy · 2014
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueX-ray Spectroscopy and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerAdipose tissueSpectroscopyChemistryMalignancyFluorescenceCancerPathologyLiver tissueFluorescence spectroscopyAnalytical Chemistry (journal)Nuclear magnetic resonanceInternal medicineMedicineOpticsBiochemistryPhysicsChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Secondary colorectal liver cancer is the most widespread malignancy in patients with colorectal cancer. The aim of this study is to identify and differentiate between normal liver tissue and malignant secondary colorectal liver cancer tissue using X-ray scattering and X-ray fluorescence spectroscopy to investigate the best combination of data that can be used to enable classification of these two tissue types. X-ray fluorescence (XRF) and coherent scatter data were collected for 24 normal and 24 tumor matched pair tissue samples. The levels of 12 elements (P, S, K, Ca, Cr, Fe, Cu, Zn, As, Se, Br, and Rb) were measured in all samples. When comparisons were made between normal and tumor tissues, statistically significant differences were determined for K (p = 0.046), Ca (p = 0.040), Cr (p = 0.011), Fe, Cu, Zn, Br, and Rb (p < 0.01). However, for P, S, As, and Se, no statistically significant differences were found (p > 0.05). For the coherent scatter spectra collected, three peaks due to adipose, fibrous content, and water content of tissue were observed. The amplitude, full width half-maximum, and area under both fibrous content and water content peaks were found to be significantly higher in secondary colorectal liver tumors compared with surrounding normal liver tissue (p < 0.05). However, no significant differences were found for the adipose peak parameters (p > 0.05). Soft independent modeling of class analogy was performed using the XRF, coherent scatter, and elemental ratio data separately, and the accuracy of the classification of 20 unknown samples was found to be 50, 30, and 80%, respectively. Further analysis has shown that using a combination of the XRF and coherent scatter data in a single combined model gave improved normal and tumor liver tissue classification, with an accuracy that was found to be 85%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,960

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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