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Enregistrement W1997016308 · doi:10.1128/jvi.01267-10

A Vaccinia Virus Deletion Mutant Reveals the Presence of Additional Inhibitors of NF-κB

2010· article· en· W1997016308 sur OpenAlexafffund
Katharine Fagan-Garcia, Michèle Barry

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyVacciniaVirologyMutantVirusPoxviridaeMutationGeneticsGeneRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The classical nuclear factor kappa B (NF-κB) signaling pathway is an important regulator of inflammation and innate immunity that is activated by a wide variety of stimuli, including virus infection, tumor necrosis factor alpha (TNF-α), and interleukin 1β (IL-1β). Poxviruses, including vaccinia virus (VV) and ectromelia virus, encode multiple proteins that function in immune evasion. Recently, a growing number of genes encoded by poxviruses have been shown to target and disrupt the NF-κB signaling pathway. To determine if additional gene products that interfere with NF-κB signaling existed, we used a vaccinia virus deletion mutant, VV811, which is missing 55 open reading frames lacking all known inhibitors of TNF-α-induced NF-κB activation. Immunofluorescence analysis of HeLa cells treated with TNF-α and IL-1β revealed that NF-κB translocation to the nucleus was inhibited in VV811-infected cells. This was further confirmed through Western blotting of cytoplasmic and nuclear extracts for NF-κB. Additionally, VV811 infection inhibited TNF-α-induced IκBα degradation. In contrast to vaccinia virus strain Copenhagen (VVCop)-infected cells, VV811 infection resulted in the dramatic accumulation of phosphorylated IκBα. Correspondingly, coimmunoprecipitation assays demonstrated that the NF-κB-inhibitory IκBα-p65-p50 complex was intact in VV811-infected cells. Significantly, cells treated with 1-β-d-arabinofuranosylcytosine, an inhibitor of poxvirus late gene expression, demonstrated that an additional vaccinia virus late gene was involved in the stabilization of IκBα. Overall, this work indicates that unidentified inhibitors of NF-κB exist in vaccinia virus. The complex inhibition of NF-κB by vaccinia virus illustrates the importance of NF-κB activation in the antiviral response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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