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Enregistrement W1997030490 · doi:10.1016/s1201-9712(03)90039-7

Serotypes of respiratory tract isolates of Streptococcus pneumoniae from Jamaican children

2003· article· en· W1997030490 sur OpenAlexaffabout
Upton Allen, Sonia M. Thomas, Jonathan R. Carapetis, Sonia Henry, Samia Wasfy, Marguerite Lovgren, Susan E. Richardson, Donald E. Low

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensSickKids FoundationProvincial Laboratory of Public HealthHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerotypeCefotaximeStreptococcus pneumoniaeMicrobiologyPneumococcal conjugate vaccineErythromycinCefuroximePenicillinCeftriaxonePneumococcal infectionsVirologyTrimethoprimBiologyMedicineAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Data are lacking on the pneumococcal serotypes present in many developing regions, including the Caribbean. We examined the serotypes of nasopharyngeal (NP) isolates of pneumococci obtained from Jamaican children. METHODS: We obtained NP samples from children seen in the Emergency Department at the Bustamante Children's Hospital. The samples were transported to Canada for isolation and serotyping of pneumococci. RESULTS: We obtained 94 isolates from 276 children; median age 3.4 years. The majority (57%) had symptoms of acute respiratory infection at the time of sampling. The main serotypes carried were 6B (20.5%), 19F (14.5%), and 14 (8.4%). Non-typable isolates accounted for 10.8% of the isolates. Fifty-nine per cent of the serotypes were present among the 11 being considered for candidate pneumococcal conjugate vaccines (95% CI 48-70%); the corresponding proportion present in the recently licensed 7-valent vaccine was 57% (95% CI 45-67%). A significant proportion of the serotypes found is absent from those to be included in future conjugate vaccines (P<0.0001; reference=85% expected serotype representation). Less than 5% of isolates were non-susceptible to penicillin (3.2%), cefotaxime-ceftriaxone (3.2%) and cefuroxime (3.2%), while 8.4% and 1.l% of isolates were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole and erythromycin respectively. There were three isolates with resistance to two or more classes of drug. These isolates were all resistant to penicillin (MIC 2 micro g/mL); the serotypes were 14, 23F, and 19F. CONCLUSION: A significant proportion of the serotypes found is absent from those to be included in future conjugate vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,064

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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