Serotypes of respiratory tract isolates of Streptococcus pneumoniae from Jamaican children
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Data are lacking on the pneumococcal serotypes present in many developing regions, including the Caribbean. We examined the serotypes of nasopharyngeal (NP) isolates of pneumococci obtained from Jamaican children. METHODS: We obtained NP samples from children seen in the Emergency Department at the Bustamante Children's Hospital. The samples were transported to Canada for isolation and serotyping of pneumococci. RESULTS: We obtained 94 isolates from 276 children; median age 3.4 years. The majority (57%) had symptoms of acute respiratory infection at the time of sampling. The main serotypes carried were 6B (20.5%), 19F (14.5%), and 14 (8.4%). Non-typable isolates accounted for 10.8% of the isolates. Fifty-nine per cent of the serotypes were present among the 11 being considered for candidate pneumococcal conjugate vaccines (95% CI 48-70%); the corresponding proportion present in the recently licensed 7-valent vaccine was 57% (95% CI 45-67%). A significant proportion of the serotypes found is absent from those to be included in future conjugate vaccines (P<0.0001; reference=85% expected serotype representation). Less than 5% of isolates were non-susceptible to penicillin (3.2%), cefotaxime-ceftriaxone (3.2%) and cefuroxime (3.2%), while 8.4% and 1.l% of isolates were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole and erythromycin respectively. There were three isolates with resistance to two or more classes of drug. These isolates were all resistant to penicillin (MIC 2 micro g/mL); the serotypes were 14, 23F, and 19F. CONCLUSION: A significant proportion of the serotypes found is absent from those to be included in future conjugate vaccines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».