Gene expression profiling of the human prostate zones
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate differences in gene expression in different zones of the prostate by microarray analyses, to better understand why aggressive tumours predominantly occur in the peripheral zone (PZ), whereas benign prostatic hyperplasia (BPH) occurs almost exclusively in the transition zone (TZ). MATERIALS AND METHODS: Expression profiling of both prostate zones was done by microarray analysis. Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) of the top 18 genes confirmed the microarray analyses. RT-PCR with common cell-type markers indicated that the differential expression between the zones was not caused by an unequal distribution of different cell types. Primary stromal and epithelial prostate cells were used to study cell type expression in the 12 highest differentially expressed zonal-specific genes. RESULTS: In all, 346 genes were identified as preferentially expressed in the TZ or PZ. A few of the TZ-specific genes, including ASPA, FLJ10970 and COCH, were also stroma-specific. Comparisons with other microarray studies showed that gene expression profiles of prostate cancer and BPH correlate with the expression profiles of the PZ and TZ, respectively. CONCLUSION: Gene expression differs between the PZ and TZ of the prostate, and stromal-epithelial interactions might be responsible for the distinct zonal localization of prostate diseases.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».