Abstract 2945: Characterization of a novel protein-coding gene named TIHL (Translocated in Hodgkin's Lymphoma)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Previously, we described the CIITA-BX648577 gene fusion (Steidl C. et al., Nature 2011) was highly expressed in Hodgkin's Lymphoma cell line KM-H2. The Class II Transactivator (CIITA) has been described to function in the regulation of immune responses and its deregulation may serve as a mechanism through which tumor cells evade immunosurveillance. In contrast, the expression and function of the gene/protein encoded by the novel locus BX648577/FLJ27352/C15orf65 is unknown. In the present study, we report the endogenous expression and describe the biological function of the novel gene which we named TIHL (Translocated in Hodgkin's Lymphoma). Comparative analysis in various species revealed high evolutionary conservation (≥50%) between human, mouse, gorilla and Drosophila TIHL orthologs. Using quantitative real time-PCR, we detected expression of full-length TIHL in both healthy and malignant hematopoietic cells. By immunoblot, we detected robust expression of the 13-16 kDa protein in leukemia and lymphoma cell lines using a TIHL-specific antibody. Lentiviral expression of TIHL in human NB4 leukemia cells and murine hematopoietic progenitor HPC-7 cells led to enhanced clonogenicity and increased proliferative capacity with significant increases in the integration of EdU (5-ethynyl-2′-deoxyuridine) and the percentage of cells in S-phase. Likewise, TIHL knockdown using 2 independent lentiviral shRNAs, led to decreased proliferation of both KG1a and NB4 leukemia cells grown in either suspension culture or semi-solid media. Ingenuity Pathway Analysis (IPA) after microarray analysis of NB4 cells overexpressing TIHL highlights significantly altered functional categories including ‘cell growth and proliferation,’ ‘cell death and survival,' and ‘cell cycle,' in line with our previous observations. In silico studies, predicted transcriptional regulators of TIHL including the gene GLI1 (Glioma-Associated Oncogene Homolog 1). GLI1, a positive regulator of the Hedgehog signaling pathway, targets genes involved in cell cycle regulation, cell proliferation and cell death. Treatment of KG1a and NB4 leukemia cells with the small molecule GLI inhibitor GANT61 led to significant inhibition of cell proliferation. Additionally, TIHL mRNA expression was significantly downregulated at increasing concentrations of GANT61 by qRT-PCR. Preliminary data suggests that TIHL overexpression may partially rescue the leukemia inhibitory effects of GANT61 treatment. These data strongly suggest that the novel gene TIHL is involved in cell cycle regulation/modulation in hematopoietic cells. Further studies will involve analysis of the effects of TIHL overexpression or knockdown in healthy donor-derived bone marrow cells, chromatin immunoprecipitation (ChIP)-PCR to confirm its direct transcriptional regulation by GLI1 and co-IP coupled to mass spectrometry to identify direct protein partners of this novel gene. Citation Format: Ujunwa C. Okoye-Okafor, Laura Barreyro, Mario Pujato, Heng Rui Wang, Boris Bartholdy, Britta Will, Tihomira I. Todorova, Masahiro Kawahara, Bruce Woolcock, Andras Fiser, Randy Gascoyne, Christian Steidl, Ulrich Steidl. Characterization of a novel protein-coding gene named TIHL (Translocated in Hodgkin's Lymphoma). [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2945. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2945
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».