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Enregistrement W1997212269 · doi:10.1371/journal.pone.0082165

A Quantitative Framework for Flower Phenotyping in Cultivated Carnation (Dianthus caryophyllus L.)

2013· article· en· W1997212269 sur OpenAlexaff
Chacón Borja, Roberto Ballester, Virginia Birlanga, Anne‐Gaëlle Rolland‐Lagan, José Manuel Pérez‐Pérez

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésCarnationPetalDianthusBiologyOrnamental plantCultivarBotanyIdeotypeHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most important breeding goals in ornamental crops are plant appearance and flower characteristics where selection is visually performed on direct offspring of crossings. We developed an image analysis toolbox for the acquisition of flower and petal images from cultivated carnation (Dianthus caryophyllus L.) that was validated by a detailed analysis of flower and petal size and shape in 78 commercial cultivars of D. caryophyllus, including 55 standard, 22 spray and 1 pot carnation cultivars. Correlation analyses allowed us to reduce the number of parameters accounting for the observed variation in flower and petal morphology. Convexity was used as a descriptor for the level of serration in flowers and petals. We used a landmark-based approach that allowed us to identify eight main principal components (PCs) accounting for most of the variance observed in petal shape. The effect and the strength of these PCs in standard and spray carnation cultivars are consistent with shared underlying mechanisms involved in the morphological diversification of petals in both subpopulations. Our results also indicate that neighbor-joining trees built with morphological data might infer certain phylogenetic relationships among carnation cultivars. Based on estimated broad-sense heritability values for some flower and petal features, different genetic determinants shall modulate the responses of flower and petal morphology to environmental cues in this species. We believe our image analysis toolbox could allow capturing flower variation in other species of high ornamental value.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,117
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,122 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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