Quantitative Proteomic Analysis of Sokotrasterol Sulfate-stimulated Primary Human Endothelial Cells
Notice bibliographique
Résumé
The endothelium forms a continuous monolayer at the interface between blood and tissue and contributes significantly to the sensing and transducing of signals between blood and tissue. New blood vessel formation, or angiogenesis, is initiated by the activation of endothelial cells and is an important process required for various pathological and physiological situations. This study used cleavable isotope-coded affinity tag reagents combined with mass spectrometry to investigate the molecular basis of a recently discovered angiogenesis-promoting steroid, sokotrasterol sulfate. Changes in the relative abundances of over 1000 proteins within human endothelial cells treated with sokotrasterol sulfate and vehicle-treated cells were identified and quantitated using this technique. A method that examines the entire ensemble of quantitative measurements was developed to identify proteins that showed a statistically significant change in relative abundance resulting from treatment with sokotrasterol sulfate. A total of 93 proteins was significantly up-regulated, and 37 were down-regulated in response to sokotrasterol sulfate stimulation of endothelial cells. Among the up-regulated proteins, several were identified that are novel to endothelial cells and are likely involved in cell communication and morphogenesis. These findings are consistent with a role for sokotrasterol sulfate in endothelial sprouting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».