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Enregistrement W1997220515 · doi:10.1155/2012/310402

Comparative Analysis of SWIRM Domain-Containing Proteins in Plants

2012· article· en· W1997220515 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueComparative and Functional Genomics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésChromatinBiologyHistoneGeneProtein domainEGF-like domainCell biologyGeneticsDNA-binding proteinHAMP domainTranscription factorBiochemistryComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromatin-remodeling complexes affect gene expression by using the energy of ATP hydrolysis to locally disrupt or alter the association of histones with DNA. SWIRM (Swi3p, Rsc8p, and Moira) domain is an alpha-helical domain of about 85 residues in chromosomal proteins. SWIRM domain-containing proteins make up large multisubunit complexes by interacting with other chromatin modification factors and may have an important function in plants. However, little is known about SWIRM domain-containing proteins in plants. In this study, 67 SWIRM domain-containing proteins from 6 plant species were identified and analyzed. Plant SWIRM domain proteins can be divided into three distinct types: Swi-type, LSD1-type, and Ada2-type. Generally, the SWIRM domain forms a helix-turn-helix motif commonly found in DNA-binding proteins. The genes encoding SWIRM domain proteins in Oryza sativa are widely expressed, especially in pistils. In addition, OsCHB701 and OsHDMA701 were downregulated by cold stress, whereas OsHDMA701 and OsHDMA702 were significantly induced by heat stress. These observations indicate that SWIRM domain proteins may play an essential role in plant development and plant responses to environmental stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,629
Score d'incertitude au seuil0,564

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle