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Enregistrement W1997242547 · doi:10.1017/s002185960800782x

Use of metabolic control analysis in lactation biology

2008· article· en· W1997242547 sur OpenAlexaff
Thomas C. Wright, J.P. Cant, B.W. McBride

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Agricultural Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolic pathwayMetabolic control analysisEnzymeBiochemistryFatty acid synthesisFlux (metallurgy)BiologyHexokinaseChemistryGlycolysisEndocrinologyInsulin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Sensitivity analysis is routinely carried out in the evaluation of simulation models to identify the degree to which parameters influence model outputs. This type of sensitivity analysis is much less frequently applied to real systems, but a technique called metabolic control analysis (MCA) was developed in the 1970s for the purpose of experimentally identifying the degree to which individual enzymes in a metabolic pathway influence flux through the pathway. MCA is applied to the results of inhibition, activation or genetic manipulation of enzymatic steps in a biochemical pathway. Flux control coefficients for each enzyme are defined as the fractional change in steady-state flux through the entire pathway for an infinitesimal change in the activity of that one enzyme. The sum of control coefficients in a linear, non-branching pathway is equal to one. It is a common finding in MCA that the control, or sensitivity, is distributed over multiple enzymes and not in a single rate-limiting enzyme. The fundamental principles of MCA are reviewed and an overview of experimental methods to measure control coefficients is provided, with the objective of introducing this approach to the fields of agricultural biochemistry and modelling, where it is little known. The application of MCA to the study of glucose metabolism and fatty acid synthesis in bovine mammary tissue are reviewed. The analyses indicated that mammary hexokinase activity exerts more control than transmembrane transport of glucose over lactose synthesis, and that control of cytosolic fatty acid synthesis is shared between acetyl-CoA carboxylase and fatty acid synthase, contrary to the widely held view that acetyl CoA carboxylase is the rate-limiting enzyme. It is suggested that MCA could be a valuable aid in the integration of proteomic and metabolomic data with metabolic flux measurements to engineer desired changes in the composition of milk from dairy animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,614
Score d'incertitude au seuil0,103

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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