MétaCan
Menu
Retour à la cohorte

Influence of ATM Function on Interactions between Telomeres and Nuclear Matrix<sup>1</sup>

2000· article· en· W1997245966 sur OpenAlexaff
Tej K. Pandita, Sayak Dhar

Notice bibliographique

RevueRadiation Research · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of Health
Mots-clésNuclear matrixTelomereBiologyAtaxia-telangiectasiaGene productCell cycleTelomeraseDNA repairMolecular biologyNuclear proteinTelomere-binding proteinGeneGeneticsCell biologyDNA damageDNAGene expressionTranscription factorChromatinDNA-binding protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ATM (ataxia telangiectasia mutated) gene product has been implicated in mitogenic signal transduction, chromosome condensation, meiotic recombination, and cell cycle control. The human ATM protein shows similarity to several yeast and mammalian proteins involved in meiotic recombination and cell cycle progression. Because of the homology of the human ATM gene to the TEL1 and rad3 genes of yeast, it has been suggested that mutations in ATM could lead to defective telomere maintenance. Recently, we have shown that the ATM gene product, which is defective in the cancer-prone disorder ataxia telangiectasia (AT), influences chromosome end associations and telomere length. A possible hypothesis explaining these results is that the defective telomere metabolism in AT cells is due to altered interactions between the telomeres and the nuclear matrix. These interactions were examined in nuclear matrix halos prior to and after irradiation. A difference was observed in the ratio of soluble and matrix-associated telomeric DNA between cells derived from AT and normal individuals. Treatment with ionizing radiation affected the ratio of soluble and matrix-associated telomeric DNA only in the AT cells. To test the hypothesis that the ATM gene product is involved in interactions between telomeres and the nuclear matrix, such interactions were examined in human cells expressing either a dominant-negative effect or complementation of the ATM gene. The phenotype of RKO colorectal tumor cells expressing ATM fragments containing a leucine zipper motif mimics the altered interactions of telomere and nuclear matrix seen in AT cells. Fibroblasts from AT individuals transfected with a wild-type ATM gene had corrected telomere-nuclear matrix interactions. In experiments designed to determine whether there is a link between the altered telomere-nuclear matrix interactions and defective telomere movement and clustering, a significant difference was observed in the ratio of soluble compared to matrix-associated telomeric DNA sequences in meiocytes of Atm(-/-) and control mice. These results suggest that the ATM gene influences the interactions between telomeres and the nuclear matrix and that alterations in telomere chromatin could be at least partly responsible for the pleiotropic phenotypes of the ATM gene. This paper summarizes our recent publications on the influence of inactivation of ATM on the interaction of telomeres with nuclear matrix in somatic and germ cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueRadiation ResearchMême sujetTelomeres, Telomerase, and SenescenceTravaux en français237 207