Primary Structure, Regioselectivity, and Evolution of the Membrane-bound Fatty Acid Desaturases of Claviceps purpurea
Notice bibliographique
Résumé
Two cDNAs with sequence similarity to fatty acid desaturase genes were isolated from the phytopathogenic fungus, Claviceps purpurea. The predicted amino acid sequences of the corresponding genes, named CpDes12 and CpDesX, share 87% identity. Phylogenetic analysis indicates that CpDes12 and CpDesX arose by gene duplication of an ancestral Delta(12)-desaturase gene after the divergence of Nectriaceae and Clavicipitaceae. Functional expression of CpDes12 and CpDesX in yeast (Saccharomyces cerevisiae) indicated that CpDes12 is primarily a "Delta(12)"-desaturase, whereas CpDesX is a novel desaturase catalyzing "Delta(12)," "Delta(15)," and "omega(3)" types of desaturation with omega(3) activity predominating. CpDesX sequentially desaturates both 16:1-9c and 18:1-9c to give 16:3-9c,12c,15c and 18:3-9c,12c,15c, respectively. In addition, it could also act as an omega(3)-desaturase converting omega(6)-polyunsaturates 18:3-6c,9c,12c, 20:3-8c,11c,14c, and 20:4-5c,8c,11c,14c to their omega(3) counterparts 18:4-6c,9c,12c,15c, 20:4-8c,11c,14c,17c, and 20:5-5c,8c,11c,14c,17c, respectively. By using reciprocal site-directed mutagenesis, we demonstrated that two residues (isoleucine at 152 and alanine at 206) are critical in defining the catalytic specificity of these enzymes and the C-terminal amino acid sequence (residues 302-477) was also found to be important. These data provide insights into the nature of regioselectivity in membrane-bound fatty acid desaturases and the relevant structural determinants. The authors suggest that the regios-electivity of such enzymes may be best understood by considering the relative importance of more than one regioselective preference. In this view, CpDesX is designated as anu + 3(omega(3)) desaturase, which primarily references an existing double bond (nu + 3 regioselectivity) and secondarily shows preference for omega(3) desaturation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».