Genomics of the 35-kb<i>pvd</i>locus and analysis of novel<i>pvdIJK</i>genes implicated in pyoverdine biosynthesis in<i>Pseudomonas aeruginosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
Novel putative pyoverdine synthetase pvdIJK genes were found upstream of pvdD in the 6.2-Mb chromosome of Pseudomonas aerugilosa strain PAO1. These genes formed a locus implicated in pyoverdine biosynthesis. Sequence analysis showed that the product of these genes shared 43%, 60% and 57% identity with PvdD. PvdIJK are thought to be implicated in synthesis of pyoverdine, a siderophore chelating Fe3+. A pvdI mutant was obtained by gene disruption mutagenesis and confirmed by Southern hybridization. The pvdl mutant produced gave no significant growth on solid media supplemented with the iron chelator 2,2-dipyridyl; while the PvdI- phenotype abolished pyoverdine fluorescence. The role of PvdI in pathogenicity was tested by measuring the in vivo growth of P. aeruginosa wild-type and mutant strains in a chronic lung infection rat model, and by measuring the competitive infectivity index into a neutropenic mice model. The data obtained confirmed the importance of PvdI in virulence and iron uptake.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».