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Enregistrement W1997450219 · doi:10.1242/dev.007567

Hox patterning of the vertebrate rib cage

2007· article· en· W1997450219 sur OpenAlexaff
Daniel C. McIntyre, Sabita Rakshit, Alisha R. Yallowitz, Luke C. Loken, Lucie Jeannotte, Mario R. Capecchi, Deneen M. Wellik

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalHôtel-Dieu de QuébecCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentMarch of Dimes Foundation
Mots-clésHox geneSomiteBiologyParaxial mesodermHomeotic geneAnatomyAxial skeletonLateral plate mesodermMesodermRib cageNODALIntermediate mesodermGeneticsEmbryogenesisPhenotypeEmbryoEmbryonic stem cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unlike the rest of the axial skeleton, which develops solely from somitic mesoderm, patterning of the rib cage is complicated by its derivation from two distinct tissues. The thoracic skeleton is derived from both somitic mesoderm, which forms the vertebral bodies and ribs, and from lateral plate mesoderm, which forms the sternum. By generating mouse mutants in Hox5, Hox6 and Hox9 paralogous group genes, along with a dissection of the Hox10 and Hox11 group mutants, several important conclusions regarding the nature of the ;Hox code' in rib cage and axial skeleton development are revealed. First, axial patterning is consistently coded by the unique and redundant functions of Hox paralogous groups throughout the axial skeleton. Loss of paralogous function leads to anterior homeotic transformations of colinear regions throughout the somite-derived axial skeleton. In the thoracic region, Hox genes pattern the lateral plate-derived sternum in a non-colinear manner, independent from the patterning of the somite-derived vertebrae and vertebral ribs. Finally, between adjacent sets of paralogous mutants, the regions of vertebral phenotypes overlap considerably; however, each paralogous group imparts unique morphologies within these regions. In all cases examined, the next-most posterior Hox paralogous group does not prevent the function of the more-anterior Hox group in axial patterning. Thus, the ;Hox code' in somitic mesoderm is the result of the distinct, graded effects of two or more Hox paralogous groups functioning in any anteroposterior location.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations258
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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