Drug-Sensitive DNA Polymerase δ Reveals a Role for Mismatch Repair in Checkpoint Activation in Yeast
Notice bibliographique
Résumé
We have used a novel method to activate the DNA damage S-phase checkpoint response in Saccharomyces cerevisiae to slow lagging-strand DNA replication by exposing cells expressing a drug-sensitive DNA polymerase δ (L612M-DNA pol δ) to the inhibitory drug phosphonoacetic acid (PAA). PAA-treated pol3-L612M cells arrest as large-budded cells with a single nucleus in the bud neck. This arrest requires all of the components of the S-phase DNA damage checkpoint: Mec1, Rad9, the DNA damage clamp Ddc1-Rad17-Mec3, and the Rad24-dependent clamp loader, but does not depend on Mrc1, which acts as the signaling adapter for the replication checkpoint. In addition to the above components, a fully functional mismatch repair system, including Exo1, is required to activate the S-phase damage checkpoint and for cells to survive drug exposure. We propose that mismatch repair activity produces persisting single-stranded DNA gaps in PAA-treated pol3-L612M cells that are required to increase DNA damage above the threshold needed for checkpoint activation. Our studies have important implications for understanding how cells avoid inappropriate checkpoint activation because of normal discontinuities in lagging-strand replication and identify a role for mismatch repair in checkpoint activation that is needed to maintain genome integrity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».