MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1997461446 · doi:10.1111/cbdd.12510

N‐(2,4)‐dinitrophenyl‐L‐arginine Interacts with EphB4 and Functions as an EphB4 Kinase Modulator

2015· article· en· W1997461446 sur OpenAlexafffund
Rhiannon Kamstra, Andrew Freywald, Wely B. Floriano

Notice bibliographique

RevueChemical Biology & Drug Design · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanLakehead UniversityThunder Bay Regional Research Institute
Organismes subventionnairesLakehead University
Mots-clésCancer researchHepatocellular carcinomaReceptor tyrosine kinaseReceptorTyrosine kinaseKinaseChemistrySignal transductionBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The erythropoietin-producing hepatocellular carcinoma receptor B4 is a receptor tyrosine kinase whose expression is preserved in various malignancies, including colon, gastric, and breast carcinoma. Hepatocellular carcinoma receptor B4 presence in tumor cells and involvement in cancer suppression makes it a potential therapeutic target for activating compounds. Moreover, modulators of its activity also have a strong potential to be used in diagnosis and therapy monitoring. We used virtual ligand screening to identify novel hepatocellular carcinoma receptor B4 kinase modulators for experimental testing. Three independent assay platforms confirmed that dinitrophenyl-L-arginine is likely to affect the kinase activity of hepatocellular carcinoma receptor B4. An enzyme-coupled spectrophotometric assay has been used to examine this possibility and may prove to be useful for assessing other novel kinase modulator candidates. Overall, our observations suggest that dinitrophenyl-L-arginine has an activating effect on hepatocellular carcinoma receptor B4 and, therefore, more efficient derivatives may have therapeutic effects in tumors where hepatocellular carcinoma receptor B4 exhibits antimalignant properties. The hepatocellular carcinoma receptor B4-activating effect is discussed with respect to previously described mechanisms, using predicted and experimental structures for docked ligands. As a novel kinase activity modulator, dinitrophenyl-L-arginine may provide new insights into molecular mechanisms by which kinases are activated or regulated, and may serve as a lead compound for the generation of novel hepatocellular carcinoma receptor B4-activating therapeutic compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemical Biology & Drug DesignMême sujetAxon Guidance and Neuronal SignalingTravaux en français237 207