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Enregistrement W1997563278 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-3836

Abstract 3836: Identification of PTPsigma as an autophagic phosphatase

2011· article· en· W1997563278 sur OpenAlexaff
Katie R. Martin, Yong Xu, Brendan D. Looyenga, Ryan J. Davis, Chia‐Lun Wu, Michel L. Tremblay, H. Eric Xu, Jeffrey P. MacKeigan

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensConcordia UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyPhosphatasePhosphatidylinositolCell biologyLysosomeKinaseProtein tyrosine phosphataseVesicleBiologyChemistryBiochemistryPhosphorylationEnzymeMembraneApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Macroautophagy is a dynamic process whereby portions of the cytosol are encapsulated in double-membrane vesicles and delivered to the lysosome for degradation. Phosphatidylinositol-3-phosphate (PI(3)P) is concentrated on autophagic vesicles and recruits effector proteins critical for this process. The production of PI(3)P by the class III phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K), Vps34, has been well established; however, protein phosphatases which antagonize this early step in autophagy remain to be identified. To identify such enzymes, we screened human phosphatase genes by RNA interference (RNAi) and found that loss of PTPsigma, a dual-domain protein tyrosine phosphatase (PTP), increases cellular PI(3)P. The abundant PI(3)P-positive vesicles conferred by PTPsigma loss strikingly phenocopied those observed in amino acid-starved cells. Accordingly, we discovered that loss of PTPsigma hyperactivates both constitutive and induced autophagy. Finally, we found that PTPsigma localizes to PI(3)P-positive membranes in cells and this vesicular localization is enhanced during autophagy. Our findings propose a novel role for PTPsigma and provide insight into the regulation of autophagy. Mechanistic knowledge of this process is critical for understanding and targeting therapies for several human diseases, including cancer and Alzheimer's disease, in which abnormal autophagy may be pathological. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 3836. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-3836

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,456
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
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