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Enregistrement W1997584369 · doi:10.1111/ivb.12029

Highly expressed genes in gonads of the bat star <i>Patiria miniata</i>: gene ontology, expression differences, and gamete recognition loci

2013· article· en· W1997584369 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInvertebrate Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensNatural Resources CanadaSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGameteGeneLocus (genetics)Evolutionary biologySpermGenomeGeneticsRepertoire

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Evolutionary analysis of mating systems in broadcast‐spawning marine animals and plants has focused on sperm‐ and egg‐surface proteins and glycopeptides that mediate reproductive interactions at different stages of gamete recognition. Improved understanding of the ecology and evolution of such interactions depends on extending our knowledge to multiple genes expressed in both sperm and eggs of diverse taxonomic groups with different modes of fertilization. Here, we use readily accessible next‐generation sequencing methods and desktop bioinformatics to characterize the repertoire of highly expressed genes in testes and ovaries of the asterinid sea star Patiria miniata , including gene ontology annotations for male‐ and female‐expressed molecules, and descriptions of two genes that encode egg‐surface molecules involved in fertilization that have not previously been studied in sea stars. The results are used to contrast expression differences between the testis and ovary, and to develop hypotheses of gamete‐specific expression. We also explore differences in ovary gene expression among multiple females from northern and southern populations that show nucleotide differentiation at many non‐expressed loci and at a gamete recognition locus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,199
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle