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Simplified quantitation of myeloid dendritic cells in peripheral blood using flow cytometry

2000· article· en· W1997681881 sur OpenAlexafffund
John W. Upham, Joachim Lundahl, Hong Liang, Judah A. Denburg, Paul M. O’Byrne, Denis P. Snider

Notice bibliographique

RevueCytometry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilMcMaster University
Mots-clésMyeloidCD33Peripheral blood mononuclear cellDendritic cellFlow cytometryCD14ImmunologyBiologyLeukapheresisMolecular biologyAndrologyMedicineImmune systemCell biologyCD34Stem cellIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recognition of the importance of dendritic cells (DC) in the initiation of T-cell-dependent immune responses has led to increasing interest in methods for the identification of DC within the circulation. We sought to develop a flow cytometric method that would allow the reliable enumeration of absolute myeloid DC counts in minimally manipulated blood samples. METHODS: Myeloid DC were identified by three-color staining of whole blood leukocytes as a discrete population of mononuclear cells expressing high levels of HLA-DR and CD33, yet having little or no expression of CD14 and CD16. This method was analyzed for reproducibility and variation in blood DC number during typical clinical day hours and after exercise. The new method was compared to an established commercial kit method. RESULTS: FACS sorting of the CD33(+) DC showed that they morphologically resembled immature DC, and developed cytoplasmic projections typical of mature DC following overnight culture in granulocyte macrophage-colony stimulating factor (GM-CSF). Within peripheral blood, these DC were found at a mean concentration of 17. 4 +/- 5.4 x 10(6) per liter, corresponding to 0.93 +/- 0.27% of mononuclear cells. Comparison of duplicate samples stained and analyzed in parallel showed that the intrasample variability was very low, with an intraclass correlation coefficient of 0.95. The frequency of CD33(+) myeloid DC and their light scatter characteristics were similar to that of CD11c(+) myeloid cells. Four-color FACS analysis revealed complete identity of CD11c(hi), HLA-DR(+) DC with CD33(+), HLA-DR(+) DC. Only rare CD33(+) DC coexpressed CD123 and HLA-DR. Numbers of blood myeloid DC, identified by CD33 staining, showed no significant variation during standard laboratory hours. However, their numbers rose significantly during vigorous exercise, in parallel to other blood cells. CONCLUSIONS: The method described herein is rapid, reproducible, requires only small volumes of blood, can be readily used by a clinical immunology laboratory, and requires fewer antibodies than a currently available commercial method.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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