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Enregistrement W1997815855 · doi:10.1074/jbc.c113.529362

The Hippo Pathway Effectors TAZ/YAP Regulate Dicer Expression and MicroRNA Biogenesis through Let-7

2013· article· en· W1997815855 sur OpenAlexaff
Steven G. Chaulk, Victoria J. Lattanzi, Samantha E. Hiemer, Richard P. Fahlman, Xaralabos Varelas

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCure Brain Cancer FoundationMarch of Dimes Foundation
Mots-clésDicerDroshaBiologymicroRNAHippo signaling pathwayCell biologyBiogenesisGene knockdownArgonauteRibonuclease IIIGene silencingEffectorRNA-binding proteinRegulation of gene expressionSmall interfering RNARNA interferenceGeneticsRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) are genome-encoded small double-stranded RNAs that have emerged as key regulators of gene expression and are implicated in most aspects of human development and disease. Canonical miRNA biogenesis involves processing of ∼70-nucleotide pre-miRNA hairpins by Dicer to generate mature ∼22-nucleotide miRNAs, which target complementary RNA sequences. Despite the importance of miRNA biogenesis, signaling mechanisms controlling this process are poorly defined. Here we demonstrate that the post-transcriptional regulation of Dicer is controlled by the cell density-mediated localization of the Hippo pathway effectors TAZ (transcriptional co-activator with PDZ-binding motif) and YAP (Yes-associated protein) (TAZ/YAP). We show that nuclear TAZ/YAP, which are abundant at low cell density, are required for efficient pre-miRNA processing. Knockdown of TAZ/YAP in low density cells, or density-mediated sequestration of TAZ/YAP into the cytoplasm, results in the defective processing of pre-miRNAs. Strikingly, one exception is Let-7, which accumulates upon loss of nuclear TAZ/YAP, leading to Let-7-dependent reduction in Dicer levels. Accordingly, inhibition of Let-7 rescues the miRNA biogenesis defects observed following TAZ/YAP knockdown. Thus, density-regulated TAZ/YAP localization defines a critical and previously unrecognized mechanism by which cells relay cell contact-induced cues to control miRNA biogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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