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Enregistrement W1997891199 · doi:10.1089/dna.2005.24.394

A Comparative Study of Fe(II) and Fe(III) Interactions with DNA Duplex: Major and Minor Grooves Bindings

2005· article· en· W1997891199 sur OpenAlex
Amin Ahmed Ouameur, Hisayuki Arakawa, R. Ahmad, M. Naoui, H.A. Tajmir‐Riahi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresInnovation and Economic Development Trois Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAnhui University of Science and Technology
Mots-clésGuanineThymineDNABinding constantPhosphateAqueous solutionCrystallographyNucleobaseStereochemistryBinding siteChemistryNucleotideBiochemistryPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The involvement of the Fe cations in autoxidation in cells and tissues is well documented. DNA is a major target in such reaction, and can chelate Fe cation in many ways. The present study was designed to examine the interaction of calf-thymus DNA with Fe(II) and Fe(III), in aqueous solution at pH 6.5 with cation/DNA (P) (P = phosphate) molar ratios (r) of 1:160 to 1:2. Capillary electrophoresis and Fourier transform infrared (FTIR) difference spectroscopic methods were used to determine the cation binding site, the binding constant, helix stability and DNA conformation in Fe-DNA complexes. Structural analysis showed that at low cation concentration (r = 1/80 and 1/40), Fe(II) binds DNA through guanine N-7 and the backbone PO(2) group with specific binding constants of K(G) = 5.40 x 10(4) M(1) and K(P) = 2.40 x 10(4) M(1). At higher cation content, Fe(II) bindings to adenine N-7 and thymine O-2 are included. The Fe(III) cation shows stronger interaction with DNA bases and the backbone phosphate group. At low cation concentration (r = 1:80), Fe(III) binds mainly to the backbone phosphate group, while at higher metal ion content, cation binding to both guanine N-7 atom and the backbone phosphate group is prevailing with specific binding constants of K(G) = 1.36 x 10(5) M(-1) and K(P) = 5.50 x 10(4) M(-1). At r = 1:10, Fe(II) binding causes a minor helix destabilization, whereas Fe(III) induces DNA condensation. No major DNA conformational changes occurred upon iron complexation and DNA remains in the B-family structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle