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Enregistrement W1997897011 · doi:10.1038/clpt.2014.89

Inflammation-Related Genetic Variations and Survival in Patients With Advanced Non–Small Cell Lung Cancer Receiving First-Line Chemotherapy

2014· article· en· W1997897011 sur OpenAlexaff
Pu Xia, Michelle A.T. Hildebrandt, Charles Lu, Jack A. Roth, David J. Stewart, Yu Zhao, Rebecca S. Heist, Y Ye, David W. Chang, Li Su, John D. Minna, Scott M. Lippman, M R Spitz, David C. Christiani, Xifeng Wu

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterNational Institutes of HealthHarvard University
Mots-clésInternal medicineOncologySingle-nucleotide polymorphismMedicineHazard ratioLung cancerConfidence intervalSNPGeneBiologyGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accurate prognostic prediction is challenging for patients with advanced-stage non-small cell lung cancer (NSCLC). We systematically investigated genetic variants within inflammation pathways as potential prognostic markers for advanced-stage NSCLC patients treated with first-line chemotherapy. A discovery phase in 502 patients and an internal validation phase in 335 patients were completed at the MD Anderson Cancer Center. External validation was performed in 371 patients at Harvard University. A missense single-nucleotide polymorphism (SNP) in the gene encoding the major histocompatibility complex class II, DO-β chain (HLA-DOB:rs2071554), predicted to influence protein function, was significantly associated with poor survival in the discovery (hazard ratio (HR): 1.46; 95% confidence interval (CI): 1.02-2.09), internal validation (HR: 1.51; 95% CI: 1.02-2.25), and external validation (HR: 1.52; 95% CI: 1.01-2.29) populations. KLRK1:rs2900420 was associated with reduced risk in the discovery (HR: 0.76; 95% CI: 0.60-0.96), internal validation (HR: 0.77; 95% CI: 0.61-0.99), and external validation (HR: 0.80; 95% CI: 0.63-1.02) populations. A strong cumulative effect on overall survival was observed for these SNPs. Genetic variations in inflammation-related genes could have potential to complement prediction of prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,714

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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