NMR Structure of an Ethylene Interstrand Cross‐Linked DNA which Mimics the Lesion Formed by 1,3‐Bis(2‐chloroethyl)‐1‐nitrosourea
Notice bibliographique
Résumé
The bisalkylating agent 1,3-bis(2-chloroethyl)-1-nitrosourea (BCNU), used in cancer chemotherapy to hinder cellular proliferation, forms lethal interstrand cross-links (ICLs) in DNA. BCNU generates an ethylene linkage connecting the two DNA strands at the N1 atom of 2'-deoxyguanosine and N3 atom of 2'-deoxycytidine, which is a synthetically challenging probe to prepare. To this end, an ICL duplex linking the N1 atom of 2'-deoxyinosine to the N3 atom of thymidine via an ethylene linker was devised as a mimic. We have solved the structure of this ICL duplex by a combination of molecular dynamics and high-field NMR experiments. The ethylene linker is well-accommodated in the duplex with minimal global and local perturbations relative to the unmodified duplex. These results may account for the substantial stabilization of the ICL duplex observed by UV thermal denaturation experiments and provides structural insights of a probe that may be useful for DNA repair studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».