Manganese–lignin peroxidase hybrid from<i>Bjerkandera adusta</i>oxidizes polycyclic aromatic hydrocarbons more actively in the absence of manganese
Notice bibliographique
Résumé
We studied polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) oxidation using whole cells and purified manganese-lignin peroxidase (MnLiP) from Bjerkandera adusta UAMH 8258. Although the metabolism of PAHs by B. adusta has been previously demonstrated, less than 5% mineralization of 14C-labelled PAHs occurred in this study over a 40-day period. Oxidation of PAHs was examined by a purified MnLiP hybrid isoenzyme in the presence and absence of manganous ions. The rate of PAH oxidation was decreased by the presence of Mn. The substrates were anthracene and its methyl derivatives, pyrene and benzo[a]pyrene, PAHs with ionization potentials of 7.43 eV or lower. The PAH metabolites of the Mn-independent reaction were identified as the corresponding quinones. The pH optimum of the Mn-independent oxidation was generally about 4, while for the Mn-dependent reaction it was 3. The kinetic constants for the Mn-independent oxidation of 2-methylanthracene at pH 4 were determined, and the values we obtained were a kcat of 145/min, KM,app of 23.8 mmol/L for the aromatic substrate, and KM,app of 0.2 mmol/L for hydrogen peroxide. This is the first report of PAH oxidation by a MnLiP hybrid isoenzyme from white rot fungi.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».