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Enregistrement W1998066239 · doi:10.1139/g03-011

Genetic diversity among accessions of an ancient olive variety of Cyprus

2003· article· en· W1998066239 sur OpenAlexvenueno aff
Georgios Banilas, John Minas, C. Gregoriou, Cathrine Demoliou, Anna Kourti, Polydefkis Hatzopoulos

Notice bibliographique

RevueGenome · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermplasmUPGMARAPDGenetic diversityGenetic similarityGenetic variationGenetic relationshipGenetic markerSimilarity (geometry)BotanyHorticultureGeneticsGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To evaluate germplasm variability and to discriminate between accessions of 'Ladolia', an ancient olive variety of Cyprus, different accessions from a germplasm collection were screened with 11 selected oligonucleotide primers in RAPD-PCRs. A total of 49 polymorphic markers were scored, the combination of which resulted in 70 distinct electrophoretic patterns. Based on either unique or combined patterns, all accessions were identified. Seven genotype-specific markers were detected. One RAPD marker could distinguish accessions according to fruit size. Genetic similarities between accessions, estimated using the Dice similarity coefficient, indicated a high degree of genetic diversity among 'Ladolia' accessions. Genetic relationships were estimated by the unweighted pair-group method with arithmetic averaging (UPGMA) and principal components analysis (PCA). Three main groups of accessions were detected. The first group was generally composed of accessions with small-sized fruits and could be further divided into two subgroups. According to PCA, most accessions with medium- or large-sized fruits were clustered together. Our results support previous observations suggesting that 'Ladolia' is actually a highly variable mixture of genetically distinct landraces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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