Isolation of <i>Streptomyces</i> sp. PCB7, the first microorganism demonstrating high-affinity uptake of tropospheric H2
Notice bibliographique
Résumé
Microbial-mediated soil uptake accounts for approximately 80% of the global tropospheric dihydrogen (H(2)) sinks. Studies conducted over the last three decades provide indirect evidences that H(2) soil uptake is mediated by free soil hydrogenases or by unknown microorganisms that have a high affinity for H(2). The exact nature of these hypothetical free soil enzymes or of H(2)-consuming microorganisms remains elusive because the activity has never been observed in pure culture. Here, we present the first aerobic microorganism able to consume tropospheric H(2) at ambient levels. A dynamic microcosm chamber was developed to enrich a microbial consortium with a high affinity for H(2), from which selected bacterial and fungal strains were isolated and tested for H(2) uptake. Strain PCB7 had a H(2) consumption activity that followed a Michaelis-Menten kinetics, with an apparent K(m) of 11 p.p.m.v. and a H(2) threshold concentration <0.100 p.p.m.v., corresponding to the high-affinity uptake of tropospheric H(2) observed in soil. 16S ribosomal RNA gene sequences showed that strain PCB7 is highly related to several Streptomyces species. H(2) consumption occurred during the sporulation period of the bacterium. Addition of nickel increased the activity, suggesting that the enzymes involved in H(2) consumption belong to the NiFe uptake class of hydrogenases. Because this is the first microorganism showing a high-affinity uptake of tropospheric H(2), we anticipate that Streptomyces sp. PCB7 will become a model organism for the understanding of the environmental factors influencing H(2) soil uptake.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».