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Enregistrement W1998204858 · doi:10.1074/jbc.m110.183574

Insights into Radicicol Biosynthesis via Heterologous Synthesis of Intermediates and Analogs

2010· article· en· W1998204858 sur OpenAlexaff
Hui Zhou 周 卉, Kangjian Qiao, Zhizeng Gao, John C. Vederas, Yi Tang 唐 奕

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésThioesteraseBiosynthesisPolyketideStereochemistryPolyketide synthaseBiochemistryChemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Resorcylic acid lactones are fungal polyketides that display diverse biological activities, with the potent Hsp90 inhibitor radicicol being an important representative member. Two fungal iterative polyketide synthases (IPKSs), Rdc5, the highly reducing IPKS, and Rdc1, the nonreducing IPKS, are required for the biosynthesis of radicicol in Pochonia chlamydosporia. In this study, the complete reconstitution of Rdc5 and Rdc1 activities both in vitro and in Saccharomyces cerevisiae uncovered the earliest resorcylic acid lactone intermediate of the radicicol biosynthetic pathway, (R)-monocillin II. The enzymatic synthesis of (R)-monocillin II confirmed the exquisite timing of the Rdc5 enoyl reductase domain. Using precursor-directed biosynthesis, the chemical modularity of the dual IPKS system was determined. Rdc1 readily accepted an N-acetylcysteamine thioester mimic of the reduced pentaketide product of Rdc5 to synthesize (R)-monocillin II with four additional iterations of polyketide elongation, indicating the C2' ketone group found in (R)-monocillin II is incorporated via the functions of Rdc1 instead of Rdc5. The involvement of the thioesterase domain in Rdc1 in macrolactonization was confirmed through both site-directed mutagenesis and domain deletion. The Rdc1 thioesterase domain was also shown to be tolerant of the opposite stereochemistry of the terminal hydroxyl nucleophile, demonstrated in the precursor-directed synthesis of the enantiomeric (S)-monocillin II. Finally, reconstitution of the halogenase Rdc2 was demonstrated both in vivo and in vitro in the synthesis of pochonin D and a new halogenated analog 6-chloro, 7',8'-dehydrozearalenol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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