MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1998242504 · doi:10.1523/jneurosci.1818-14.2014

Mesoscale Transcranial Spontaneous Activity Mapping in GCaMP3 Transgenic Mice Reveals Extensive Reciprocal Connections between Areas of Somatomotor Cortex

2014· article· en· W1998242504 sur OpenAlexafffund
Matthieu P. Vanni, Timothy H. Murphy

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésNeuroscienceSomatosensory systemMotor cortexCoactivationNeuropilVisual cortexCortex (anatomy)Premovement neuronal activityPrimary motor cortexNeocortexBiologyCentral nervous systemElectromyography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transgenic mice expressing genetically encoded activity indicators are an attractive means of mapping mesoscopic regional functional cortical connectivity given widespread stable and cell-specific expression compatible with chronic recordings. Cortical functional connectivity was evaluated using wide-field imaging in lightly anesthetized Emx1-creXRosa26-GCaMP3 mice expressing calcium sensor in cortical neurons. Challenges exist because green fluorescence signals overlap with endogenous activity-dependent autofluorescence and are affected by changes in blood volume and oxygenation. Under the conditions used for imaging and analysis (0.1-1 Hz frequency band), autofluorescence and hemodynamic effects contributed 3% and 8% of the SD of spontaneous activity-dependent GCaMP3 fluorescence when signals were recorded through intact bone. To evaluate the accuracy and sensitivity of this approach, the topology of functional connections between somatomotor cortex (primary S1 and secondary S2 somatosensory, and primary motor cortex M1) was estimated. During sequences of spontaneous activity, calcium signals recorded at each location of area S1 were correlated with activity in contralateral area S1, ipsilateral area S2, and bilateral areas M1. Reciprocal results were observed when "seed pixels" were placed in S2 and M1. Coactivation of areas implies functional connections but could also be attributed to both regions receiving common upstream drive. These apparent connections revealed during spontaneous activity coactivation by GCaMP3 were confirmed by intracortical microstimulation but were more difficult to detect using intrinsic signals from reflected red light. We anticipate GCAMP wide-field imaging will enable longitudinal studies during plasticity paradigms or after models of CNS disease, such as stroke, where the weighting within these connectivity maps may be altered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations191
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of NeuroscienceMême sujetFunctional Brain Connectivity StudiesTravaux en français237 207