MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1998364981 · doi:10.1002/humu.22629

Mutation in The Nuclear-Encoded Mitochondrial Isoleucyl-tRNA Synthetase<i>IARS2</i>in Patients with Cataracts, Growth Hormone Deficiency with Short Stature, Partial Sensorineural Deafness, and Peripheral Neuropathy or with Leigh Syndrome

2014· article· en· W1998364981 sur OpenAlexafffund
Jeremy Schwartzentruber, Daniela Buhaş, Jacek Majewski, Florin Sasarman, Simon Papillon‐Cavanagh, Isabelle Thiffaut, Katherine Sheldon, Christine Massicotte, Lysanne Patry, Mariella Simon, Amir S. Zare, Kevin McKernan, Jacques L. Michaud, Richard G. Boles, Cheri Deal, Valérie Désilets, Eric A. Shoubridge, Mark E. Samuels

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Children's HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésBiologyMissense mutationShort statureGeneticsExome sequencingCataractsCompound heterozygosityMutationMitochondrial diseaseSensorineural hearing lossHearing lossMitochondrial DNAEndocrinologyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the nuclear-encoded mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetases are associated with a range of clinical phenotypes. Here, we report a novel disorder in three adult patients with a phenotype including cataracts, short-stature secondary to growth hormone deficiency, sensorineural hearing deficit, peripheral sensory neuropathy, and skeletal dysplasia. Using SNP genotyping and whole-exome sequencing, we identified a single likely causal variant, a missense mutation in a conserved residue of the nuclear gene IARS2, encoding mitochondrial isoleucyl-tRNA synthetase. The mutation is homozygous in the affected patients, heterozygous in carriers, and absent in control chromosomes. IARS2 protein level was reduced in skin cells cultured from one of the patients, consistent with a pathogenic effect of the mutation. Compound heterozygous mutations in IARS2 were independently identified in a previously unreported patient with a more severe mitochondrial phenotype diagnosed as Leigh syndrome. This is the first report of clinical findings associated with IARS2 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,524
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman MutationMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207