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Enregistrement W1998386999 · doi:10.1002/art.21755

Genetic variation in toll‐like receptor 9 and susceptibility to systemic lupus erythematosus

2006· article· en· W1998386999 sur OpenAlexaff
Philip L. De Jager, Angela M. Richardson, Tim J. Vyse, John D. Rioux

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatism · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismImmunologyHaplotypeLupus nephritisBiologyAlleleGeneticsLinkage disequilibriumGenetic variationGenetic predispositionGenetic associationAllele frequencyGeneGenotypeMedicineDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Autoantibodies produced by differentiated B cells play an important role in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus (SLE). The Toll-like receptor 9 (TLR-9) gene has recently emerged as an important costimulatory molecule for both B cells and dendritic cells that respond to chromatin immune complexes. Genetic variation affecting the function of TLR-9 may therefore increase or decrease the threshold of B cell or dendritic cell activation. This variability in activation threshold may, in turn, affect an individual's susceptibility to SLE. This study assessed the role of genetic variation within the TLR-9 gene in susceptibility to SLE. METHODS: We genotyped 362 SLE-affected subject/parent trios for 10 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) covering a 68,742-bp genomic segment that contains the TLR-9 gene and approximately 60 kb of flanking sequence. We analyzed the data using the transmission disequilibrium test. RESULTS: There was no association of susceptibility to SLE with any of the 9 SNPs that generated usable data or the 8 haplotypes found at a frequency of >0.05 in this population. When analyzing the subset of 143 subjects with lupus nephritis, there was also no evidence of association between disease susceptibility and any SNP or haplotype. CONCLUSION: These results indicate that there is no evidence that common (frequency higher than 5%) alleles of the TLR-9 gene contribute significantly to the genetic risk involved in susceptibility to SLE or lupus nephritis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,905
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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