Molecular Phylogenetic Analysis, Trichothecene Chemotype Patterns, and Variation in Aggressiveness of <i>Fusarium</i> Isolates Causing Head Blight in Wheat
Notice bibliographique
Résumé
Certain Fusarium species cause Fusarium head blight (FHB) in wheat and other small grains. Differences in characteristics of the pathogen species/isolates used in breeding programs may affect reaction of host genotypes, leading to erroneous results. To clarify differences among Fusarium isolates from different geographical zones, the phylogenetic, chemotypic, and pathogenic abilities of 58 isolates collected from three wheat-producing countries (Canada, Mexico, and Iran) were investigated. Phylogenetic relationships among the isolates were characterized using the Tri101 gene sequence. All Canadian and Iranian isolates clustered in one group and were identified as F. graminearum lineage 7 (=F. graminearum sensu stricto) within the F. graminearum (Fg) clade. The isolates from Mexico were identified as either F. graminearum lineage 3 (=Fusarium boothii) within the Fg clade or Fusarium crookwellense. A polymerase chain reaction assay based on the Tri12 gene identified three trichothecene chemotypes of 15-ADON, 3- ADON, and NIV, with 15-ADON being the most common. All F. boothii isolates from Mexico were of the 15-ADON chemotype, while all F. crookwellense isolates were determined to be NIV producers. While we did not find the NIV chemotype among the Canadian isolates, 25.6% of the Iranian isolates were determined to be NIV producers. High level of variation in aggressiveness was also observed among and within the species tested: F. graminearum sensu stricto isolates were the most aggressive, followed by those of F. boothii, and lastly by F. crookwellense. The differences observed among the isolates may explain why wheat lines/cultivars demonstrate different reactions to FHB in different geographical zones.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».