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Enregistrement W1998452896 · doi:10.1152/physiolgenomics.00171.2012

Changes in the mitochondrial phosphoproteome during mammalian hibernation

2013· article· en· W1998452896 sur OpenAlexafffund
Dillon J. Chung, Beata Szyszka, Jason C. L. Brown, Norman P. A. Hüner, James F. Staples

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesResearch Manitoba
Mots-clésTorporBiologyHibernation (computing)PhosphorylationMitochondrionProtein phosphorylationRespirationBiochemistryCell biologyEndocrinologyProtein kinase AThermoregulationAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian hibernation involves periods of substantial suppression of metabolic rate (torpor) allowing energy conservation during winter. In thirteen-lined ground squirrels (Ictidomys tridecemlineatus), suppression of liver mitochondrial respiration during entrance into torpor occurs rapidly (within 2 h) before core body temperature falls below 30°C, whereas reversal of this suppression occurs slowly during arousal from torpor. We hypothesized that this pattern of rapid suppression in entrance and slow reversal during arousal was related to changes in the phosphorylation state of mitochondrial enzymes during torpor catalyzed by temperature-dependent kinases and phosphatases. We compared mitochondrial protein phosphorylation among hibernation metabolic states using immunoblot analyses and assessed how phosphorylation related to mitochondrial respiration rates. No proteins showed torpor-specific changes in phosphorylation, nor did phosphorylation state correlate with mitochondrial respiration. However, several proteins showed seasonal (summer vs. winter) differences in phosphorylation of threonine or serine residues. Using matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight/time of flight mass spectrometry, we identified three of these proteins: F1-ATPase α-chain, long chain-specific acyl-CoA dehydrogenase, and ornithine transcarbamylase. Therefore, we conclude that protein phosphorylation is likely a mechanism involved in bringing about seasonal changes in mitochondrial metabolism in hibernating ground squirrels, but it seems unlikely to play any role in acute suppression of mitochondrial metabolism during torpor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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