MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1998626253 · doi:10.1139/g00-039

Identification of AFLP markers on the satellite region of chromosome 1BS in wheat

2000· article· en· W1998626253 sur OpenAlexvenueno aff
Hangning Zhang, Shuhei Nasuda, Takashi R. Endo

Notice bibliographique

RevueGenome · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmplified fragment length polymorphismBiologyGeneticsChromosomeRestriction fragment length polymorphismPrimer (cosmetics)GenomeCommon wheatGeneRestriction fragmentPopulationLocus (genetics)Polymerase chain reactionGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The satellite region on the short arm of chromosome 1B in wheat (Triticum aestivum L., 2n = 6x = 42) carries many agronomically important genes; i.e., genes conferring fungal disease resistance, seed storage proteins, and fertility restoration. To find molecular markers located on the satellite region, we applied the fluorescent AFLP (amplified fragment length polymorphism) technique to aneuploids and deletion stocks of the cultivar T. aestivum 'Chinese Spring'. Out of 6017 fragments amplified with 80 primer combinations in normal 'Chinese Spring', 24 were assigned to 1BS. Twelve of them clustered within a small region of the satellite known to be rich in RFLP (restriction fragment length polymorphism) markers. AFLPs in 1BS and in the whole genome were calculated between 'Chinese Spring' and T. spelta var. duhamelianum. The polymorphism rates in the satellite region (58.3%) and in the 1BS arm (45.8%) were much higher than the average rate for the whole genome (10.7%). Seven of the 12 AFLP markers in the satellite region were revealed to be specific to 'Chinese Spring' and could potentially be useful for genetic mapping in a segregation population of 'Chinese Spring' x T. spelta.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenomeMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207