Low Energy Electron Interactions with Uracil: The Energetics Predicted by Theory
Notice bibliographique
Résumé
Low energy electrons (LEEs) induce strand breaks and base damage in DNA and RNA via fragmentation of molecular bonding. This includes the formation of hydrogen atoms from N−H and C−H bond dissociations in the bases thymine, cytosine and uracil, respectively. To better understand the dissociation of uracil induced by LEEs, we theoretically characterized the potential energy surfaces (PESs) along the N−H and C−H bonds of the uracil anion, as well as the energetics involved. The PESs show that an activation barrier of less than 1 eV exists for the N 1 −H dissociation with rather flat PES beyond N−H = ∼1.5 Å. The PESs for C 5 −H and C 6 −H show larger barriers, which increase monotonically with bond stretching. All the N−H and C−H bond dissociations are endothermic; the adiabatic PESs suggest the energy threshold for formation of hydrogen from N−H and C−H bonds are in the order: 0.78 (N 1 −H) < 1.3 (N 3 −H) < 2.2 (C 6 −H) < 2.7 eV (C 5 −H). The H-deleted uracil radicals (U-yl radical family) are found to have exceptionally high adiabatic electron affinities, namely, 3.46 (N 1 ), 3.8 (N 3 ), 2.35 (C 5 ), and 2.67 eV (C 6 ). During the H bond breaking process of an uracil transient anion, these electron affinities compensate the extra energy needed to break the N−H or C−H bonds. This process may therefore explain the large hydrogen yield found experimentally from uracil upon attachment of LEEs. Potential applications of this process for the synthesis of uracil analogues using LEE irradiation are suggested.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».