Molecular genetic analysis of genomes of porcine respiratory and reproductive syndrome viruses and porcine circovirus type 2 circulating on the territory of the Russian federation
Notice bibliographique
Résumé
A molecular genetic analysis of genomes of porcine reproductive respiratory syndrome virus (PRRSV) and porcine circovirus type 2 (PCV-2) circulating in the territory of the Russian Federation is given. The results of the study showed the presence of circulation of European genotypes of PRRSV strains that are similar to isolates found in France and Denmark from 1998 to 2001. We explained the homology of a fragment of one of the genes between the Russian isolates and the vaccine strain used in Porcilis PRRS (Intervet) vaccine, but this requires further study. Strains of the North American genotype of PRRS were not found. The PCV-2 genomes fall into three separate groups. One (genotype 2b) is formed by isolates in Malaysia, Brazil, Switzerland, China, Slovakia, the United Kingdom, and the United States, which were isolated during the period from 2004 to the present time. The second group consists of the field sequences of viruses isolated in 2000–2012 in Canada, the United States, China, and South Korea (genotype 2a). The third group is formed by highly pathogenic isolates evolved in 2013 in China (genotype 2c). The circulation of all three known genotypes of PCV-2-2a, 2b, and 2c-in the Russian Federation was shown.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».