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Enregistrement W1998990297 · doi:10.1097/pas.0b013e3181c7997b

Variability in Diagnostic Opinion Among Pathologists for Single Small Atypical Foci in Prostate Biopsies

2010· article· en· W1998990297 sur OpenAlexaff
Theodorus van der Kwast, Andrew Evans, Gina Lockwood, Doug Tkachuk, David G. Bostwick, Jonathan I. Epstein, Peter A. Humphrey, Rodolfo Montironi, Geert J.L.H. van Leenders, Carl‐Gustaf Pihl, I. Neetens, Paula Kujala, Marita Laurila, C. Mazerolles, Lukas Bubendorf, Antonio Finelli, Kemp Watson, John R. Srigley

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMalignancyBiopsyPathologyProstate cancerSurgical pathologyProstateH&E stainAdenocarcinomaAnatomical pathologyRadiologyCancerInternal medicineImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathologists are increasingly exposed to prostate biopsies with small atypical foci, requiring differentiation between adenocarcinoma, atypical small acinar proliferation suspicious for malignancy, and a benign diagnosis. We studied the level of agreement for such atypical foci among experts in urologic pathology and all-round reference pathologists of the European Randomized Screening study of Prostate Cancer (ERSPC). For this purpose, we retrieved 20 prostate biopsies with small (most <1 mm) atypical foci. Hematoxylin and eosin-stained slides, including 10 immunostained slides were digitalized for virtual microscopy. The lesional area was not marked. Five experts and 7 ERSPC pathologists examined the cases. Multirater kappa statistics was applied to determine agreement and significant differences between experts and ERSPC pathologists. The kappa value of experts (0.39; confidence interval, 0.29-0.49) was significantly higher than that of ERSPC pathologists (0.21; confidence interval, 0.14-0.27). Full (100%) agreement was reached by the 5 experts for 7 of 20 biopsies. Experts and ERSPC pathologists rendered diagnoses ranging from benign to adenocarcinoma on the same biopsy in 5 and 9 biopsies, respectively. Most of these lesions comprised between 2 and 5 atypical glands. The experts diagnosed adenocarcinoma (49%) more often than the ERSPC pathologists (32%) (P<0.001). As agreement was particularly poor for foci comprising <6 glands, we would encourage pathologists to obtain intercollegial consultation of a specialized pathologist for these lesions before a carcinoma diagnosis, whereas clinicians may consider to perform staging biopsies before engaging on deferred or definite therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,054
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,161
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,286

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0540,161
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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