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Enregistrement W1999225239 · doi:10.1186/1471-2202-8-s2-p128

Effect of T-channel distribution on firing pattern of the thalamocortical cell

2007· article· en· W1999225239 sur OpenAlexafffund
Reza Zomorrodi, H. Kröger, Igor Timofeev

Notice bibliographique

RevueBMC Neuroscience · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCompartment (ship)Permeability (electromagnetism)BurstingBiological systemPhysicsChannel (broadcasting)NeuroscienceBiophysicsChemistryComputer scienceBiologyTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The low-threshold calcium current (IT) underlies burst generation in thalamocortical (TC) relay cells and plays a central role in the genesis of synchronized oscillations by thalamic circuits. Ascending and descending inputs to thalamic relay cells arrive on the dendritic tree, thus the study of synaptic integration in model cells requires simulations incorporating the electrically active properties of the dendritic tree. We developed a 3-compartment model of a thalamocortical cell to consider effects of dendritic currents on the response of the cell. First, we attribute uniform T-channel distribution for all compartments in the model, then we find a threshold value of channel permeability, Pca = 1.56e-4 (cm/sec) that enables generation of a low-threshold calcium spike (LTS). By multiplying the permeability of each section by its area we estimated the threshold number of channels necessary to reproduce an LTS. While we kept the total number of channels constant, we attributed different calcium permeability to the different compartments. Our simulations show, independent of the Ca2+ channel distribution, for a total channel number below the threshold value that the cell gives a passive response and above the threshold, the model reproduces the LTS spike. In a small range below the threshold the difference between uniform and non uniform distributions becomes visible. In the range of 1–2% below threshold a uniform distribution of T-channels produces a passive response while a non-uniform distribution reproduces an LTS response. A comparison with experimental data of firing patterns and the I-V curve of the T-current shows a non-uniform distribution with higher density in sections near the soma better represents the experimental data. However, the geometry of the I-V-curve of the T-current strongly depends on the quality of the voltage clamp. Depending on the electrode resistance, the maximum of the I-V-curve can change from (6 nA, -60 mV) to (3 nA, -40 mV). In addition we investigated the influence of the cell size on firing patterns. The model shows that with the same number of channels, the frequency of tonic firing increases with a decrease in the cell size, while the LTS response increases with an increase in cell size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
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