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Enregistrement W1999272322 · doi:10.3899/jrheum.091110

Genetic Variations in Genes Encoding RANK, RANKL, and OPG in Rheumatoid Arthritis: A Case-Control Study

2010· article· en· W1999272322 sur OpenAlexvenueno aff
G. Aßmann, Jochem Koenig, Michael Pfreundschuh, Joern Kekow, Klaus Roemer, Stefan Wieczorek

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBone Metabolism and Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismSNPRANKLGenotypeInternal medicineMedicineRheumatoid arthritisRANK LigandOsteoprotegerinMinor allele frequencyRheumatologyAlleleAllele frequencyArthritisEndocrinologyImmunologyGeneticsGeneReceptorBiologyActivator (genetics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic autoimmune disease characterized by chronic inflammation of the joints, which may lead to structural damage of the cartilage and bone. The receptor activator of nuclear factor-kappaB (RANK) and the osteoprotegerin (OPG) cascade system have been reported to be essential in osteoclastogenesis. Genetic variations in the genes coding for RANK, RANK ligand (RANKL), and OPG are thought to play roles in the susceptibility to RA. METHODS: In our case-control study, genomic DNA was obtained from 534 patients with RA who fulfilled the American College of Rheumatology 1987 criteria and 516 healthy control blood donors (HC). We studied 7 single-nucleotide polymorphisms (SNP) in the genes of RANK (2 SNP: rs1805034, rs35211496), OPG (2 SNP: rs3102735, rs2073618), and RANKL (3 SNP: rs9533156, rs2277438, rs1054016) using TaqMan assay-guided polymerase chain reaction. Genotype and allelic frequencies comparing RA patients with HC were analyzed by chi-square test for 2 x 3 and 2 x 2 tables, respectively. RESULTS: Genotype distributions of the SNP rs35211496 in the RANK gene as well as the SNP rs2277438 in the RANKL gene differed significantly between patients with RA and HC. The frequency of the minor allele of rs9533156 of RANKL was significantly higher in patients with RA than in HC (OR 0.84, 95% CI 0.71-0.99, p = 0.047). Multivariate analysis adjusted to sex and investigating SNP demonstrated a significantly elevated risk for RA associated with the major allele in the RANK SNP rs35211496 (p = 0.0231) and with the minor allele in the RANKL SNP rs2277438 (p = 0.0092). No significantly increased risk was detected in the other SNP. CONCLUSION: The minor allele of the RANK SNP rs35211496 may be protective against RA, while the minor alleles of the RANKL SNP rs2277438 may increase susceptibility to RA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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