Genetic Variations in Genes Encoding RANK, RANKL, and OPG in Rheumatoid Arthritis: A Case-Control Study
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic autoimmune disease characterized by chronic inflammation of the joints, which may lead to structural damage of the cartilage and bone. The receptor activator of nuclear factor-kappaB (RANK) and the osteoprotegerin (OPG) cascade system have been reported to be essential in osteoclastogenesis. Genetic variations in the genes coding for RANK, RANK ligand (RANKL), and OPG are thought to play roles in the susceptibility to RA. METHODS: In our case-control study, genomic DNA was obtained from 534 patients with RA who fulfilled the American College of Rheumatology 1987 criteria and 516 healthy control blood donors (HC). We studied 7 single-nucleotide polymorphisms (SNP) in the genes of RANK (2 SNP: rs1805034, rs35211496), OPG (2 SNP: rs3102735, rs2073618), and RANKL (3 SNP: rs9533156, rs2277438, rs1054016) using TaqMan assay-guided polymerase chain reaction. Genotype and allelic frequencies comparing RA patients with HC were analyzed by chi-square test for 2 x 3 and 2 x 2 tables, respectively. RESULTS: Genotype distributions of the SNP rs35211496 in the RANK gene as well as the SNP rs2277438 in the RANKL gene differed significantly between patients with RA and HC. The frequency of the minor allele of rs9533156 of RANKL was significantly higher in patients with RA than in HC (OR 0.84, 95% CI 0.71-0.99, p = 0.047). Multivariate analysis adjusted to sex and investigating SNP demonstrated a significantly elevated risk for RA associated with the major allele in the RANK SNP rs35211496 (p = 0.0231) and with the minor allele in the RANKL SNP rs2277438 (p = 0.0092). No significantly increased risk was detected in the other SNP. CONCLUSION: The minor allele of the RANK SNP rs35211496 may be protective against RA, while the minor alleles of the RANKL SNP rs2277438 may increase susceptibility to RA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».