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Enregistrement W1999355722 · doi:10.1007/s00122-013-2109-6

Identification and mapping in spring wheat of genetic factors controlling stem rust resistance and the study of their epistatic interactions across multiple environments

2013· article· en· W1999355722 sur OpenAlexafffundabout
Arti Singh, R. E. Knox, R. M. DePauw, Richard D. Cuthbert, Heather Campbell, Davinder Singh, Sridhar Bhavani, T. Fetch, F. R. Clarke

Notice bibliographique

RevueTheoretical and Applied Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaScheme for Promotion of Academic and Research CollaborationWestern Grains Research Foundation
Mots-clésStem rustBiologyQuantitative trait locusDoubled haploidyEpistasisPopulationPucciniaAgronomyMain stemCultivarHorticultureGeneticsGeneMildew

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stem rust (Puccinia graminis f. sp. tritici) is responsible for major production losses in hexaploid wheat (Triticum aestivum L.) around the world. The spread of stem rust race Ug99 and variants is a threat to worldwide wheat production and efforts are ongoing to identify and incorporate resistance. The objectives of this research were to identify quantitative trait loci (QTL) and to study their epistatic interactions for stem rust resistance in a population derived from the Canadian wheat cultivars AC Cadillac and Carberry. A doubled haploid (DH) population was developed and genotyped with DArT(®) and SSR markers. The parents and DH lines were phenotyped for stem rust severity and infection response to Ug99 and variant races in 2009, 2010 and 2011 in field rust nurseries near Njoro, Kenya, and to North American races in 2011 and 2012 near Swift Current, SK, Canada. Seedling infection type to race TTKSK was assessed in a bio-containment facility in 2009 and 2012 near Morden, MB. Eight QTL for stem rust resistance and three QTL for pseudo-black chaff on nine wheat chromosomes were identified. The phenotypic variance (PV) explained by the stem rust resistance QTL ranged from 2.4 to 48.8 %. AC Cadillac contributed stem rust resistance QTL on chromosomes 2B, 3B, 5B, 6D, 7B and 7D. Carberry contributed resistance QTL on 4B and 5A. Epistatic interactions were observed between loci on 4B and 5B, 4B and 7B, 6D and 3B, 6D and 5B, and 6D and 7B. The stem rust resistance locus on 6D interacted synergistically with 5B to improve the disease resistance through both crossover and non-crossover interactions depending on the environment. Results from this study will assist in planning breeding for stem rust resistance by maximizing QTL main effects and epistatic interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,806
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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