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Enregistrement W1999413206 · doi:10.1038/ajg.2013.354

EMerging BiomARKers in Inflammatory Bowel Disease (EMBARK) Study Identifies Fecal Calprotectin, Serum MMP9, and Serum IL-22 as a Novel Combination of Biomarkers for Crohn's Disease Activity: Role of Cross-Sectional Imaging

2013· article· en· W1999413206 sur OpenAlexaff
William A. Faubion, Joel G. Fletcher, Sharon O’Byrne, Brian G. Feagan, Willem J. de Villiers, Bruce Salzberg, Scott E. Plevy, Deborah D. Proctor, John F. Valentine, Peter Higgins, Jeffrey M. Harris, Lauri Diehl, Lilyan Wright, Gaik W. Tew, Diana Luca, Karen Basu, Mary Keir

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalprotectinMedicineBiomarkerGastroenterologyInternal medicineCrohn's diseaseInflammatory bowel diseaseUlcerative colitisFecesDiseaseArea under the curve

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: In Crohn's disease (CD), clinical symptoms correspond poorly to inflammatory disease activity. Biomarkers reflective of mucosal and bowel wall inflammation would be useful to monitor disease activity. The EMBARK study evaluated disease activity in patients with ulcerative colitis (UC) and CD, and used endoscopy with or without cross-sectional imaging for biomarker discovery. METHODS: UC (n=107) and CD (n=157) patients were characterized and underwent ileocolonoscopy (ICO). A subset of CD patients (n=66) also underwent computed tomography enterography (CTE). ICO and CTE were scored by a gastroenterologist and radiologist who incorporated findings of inflammation into a single score (ICO-CTE) for patients that underwent both procedures. Serum and fecal biomarkers were evaluated for association with the Mayo Clinic endoscopy score in UC patients and with ICO alone or ICO-CTE in CD patients. Individual biomarkers with a moderate degree of correlation (P≤0.3) were evaluated using multivariate analysis with model selection using a stepwise procedure. RESULTS: In UC, ordinal logistic regression using Mayo Clinic endoscopy subscore selected the combination of fecal calprotectin and serum matrix metalloproteinase 9 (MMP9; pseudo R(2)=0.353). In CD, we found that use of the ICO-CTE increased specificity of known biomarkers. Using ICO-CTE as the dependent variable for biomarker discovery, the selected biomarkers were the combination of fecal calprotectin, serum MMP9, and serum IL-22 (r=0.699). CONCLUSIONS: Incorporation of both ICO and CTE into a single measure increased biomarker performance in CD. Combinations of fecal calprotectin and serum MMP9 for UC, and combinations of fecal calprotectin, serum MMP9, and serum interleukin-22 in CD, demonstrated the strongest association with imaging/endoscopy-defined inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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