The Demosponge <i>Amphimedon queenslandica</i>: Reconstructing the Ancestral Metazoan Genome and Deciphering the Origin of Animal Multicellularity
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Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTIONSponges are one of the earliest branching metazoans. In addition to undergoing complex development and differentiation, they can regenerate via stem cells and can discern self from nonself ("allorecognition"), making them a useful comparative model for a range of metazoan-specific processes. Molecular analyses of these processes have the potential to reveal ancient homologies shared among all living animals and critical genomic innovations that underpin metazoan multicellularity. Amphimedon queenslandica (Porifera, Demospongiae, Haplosclerida, Niphatidae) is the first poriferan representative to have its genome sequenced, assembled, and annotated. Amphimedon exemplifies many sessile and sedentary marine invertebrates (e.g., corals, ascidians, bryozoans): They disperse during a planktonic larval phase, settle in the vicinity of conspecifics, ward off potential competitors (including incompatible genotypes), and ensure that brooded eggs are fertilized by conspecific sperm. Using genomic and expressed sequence tag (EST) resources from Amphimedon, functional genomic approaches can be applied to a wide range of ecological and population genetic processes, including fertilization, dispersal, and colonization dynamics, host-symbiont interactions, and secondary metabolite production. Unlike most other sponges, Amphimedon produce hundreds of asynchronously developing embryos and larvae year-round in distinct, easily accessible brood chambers. Embryogenesis gives rise to larvae with at least a dozen cell types that are segregated into three layers and patterned along the body axis. In this article, we describe some of the methods currently available for studying A. queenslandica, focusing on the analysis of embryos, larvae, and post-larvae.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle