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Enregistrement W1999454547 · doi:10.2741/1984

Identification of an octamer-binding site controlling the activity of the small breast epithelial mucin gene promoter

2006· article· en· W1999454547 sur OpenAlexaff
Florent Hubé

Notice bibliographique

RevueFrontiers in bioscience · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTranscription factorPromoterGene expressionMolecular biologyGeneCancer researchGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e human small breast epithelial mucin (SBEM) gene has been identified as being preferentially expressed in mammary epithelial cells and over-expressed in breast tumors. In this report, we have characterized the promoter of SBEM gene in order to identify sequences responsible for this strong mammary expression. A series of SBEM promoter/luciferase constructs were transiently transfected into both breast (MCF-7, BT-20) and non-breast (HeLa and HepG2) cell lines. In addition to the minimal promoter and to a repressor region, we have identified an 87-bp sequence (-357/-270) driving a strong breast-specific expression. Site-directed mutagenesis of a putative octamer-binding transcription factor binding site located within this latter region led to a strong decrease of the transcriptional activity of the SBEM promoter. Furthermore, transient over-expression of Oct1 and Oct2 not only increased SBEM promoter reporter activity, but also enhanced endogenous SBEM mRNA level. Overall, the data suggest that octamer-binding transcription factors participate in the strong expression of SBEM gene in breast tissues. Clarifying the SBEM gene regulation will help to dissect mechanisms underlying transcription of normal breast and breast cancer-associated genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,178

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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