Deletion of the AU-Rich RNA Binding Protein Apobec-1 Reduces Intestinal Tumor Burden in <i>Apcmin</i> Mice
Notice bibliographique
Résumé
The RNA-specific cytidine deaminase apobec-1 is an AU-rich RNA binding protein that binds the 3' untranslated region (UTR) of cyclooxygenase-2 (Cox-2) mRNA and stabilizes its turnover in vitro. Cox-2 overexpression accompanies intestinal adenoma formation in both humans and mice. Evidence from both genetic deletion studies as well as from pharmacologic inhibition has implicated Cox-2 in the development of intestinal adenomas in experimental animals and in adenomas and colorectal cancer in humans. Here, we show that small intestinal adenoma formation is dramatically reduced in compound Apc(min/+) apobec-1(-/-) mice when compared with the parental Apc(min/+) strain. This reduced tumor burden was found in association with increased small intestinal apoptosis and reduced proliferation in small intestinal crypt-villus units from compound Apc(min/+) apobec-1(-/-) mice. Intestinal adenomas from compound Apc(min/+) apobec-1(-/-) mice showed a <2-fold increase in Cox-2 mRNA abundance and reduced prostaglandin E(2) content compared with adenomas from the parental Apc(min/+) strain. In addition, there was reduced expression in adenomas from compound Apc(min/+) apobec-1(-/-) mice of other mRNAs (including epidermal growth factor receptor, peroxisome proliferator-activated receptor delta, prostaglandin receptor EP4, and c-myc), each containing the apobec-1 consensus binding site within their 3'-UTR. Adenovirus-mediated apobec-1 introduction into HCA-7 (colorectal cancer) cells showed a dose-dependent increase in Cox-2 protein and stabilization of endogenous Cox-2 mRNA. These findings suggest that deletion of apobec-1, by modulating expression of AU-rich RNA targets, provides an important mechanism for attenuating a dominant genetic restriction point in intestinal adenoma formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».