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Enregistrement W1999626604 · doi:10.1097/00054725-200211000-00001

Using a Genome-Wide Scan and Meta-analysis to Identify a Novel IBD Locus and Confirm Previously Identified IBD Loci

2002· review· en· W1999626604 sur OpenAlexaffabout
Caitlin Williams, Kerry Kocher, Eric S. Lander, Mark J. Daly, John D. Rioux

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2002
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensQueen Elizabeth II Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocus (genetics)Meta-analysisComputational biologyGenome ScanGeneticsGenome-wide association studyGenomeBiologyMedicineGeneInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismAlleleGenotypeMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Seven loci that potentially confer susceptibility to inflammatory bowel disease (IBD) or one of its subtypes have been identified to date; however, most are unconfirmed, and the complete set of loci contributing to disease susceptibility has not yet been determined. The authors aim to identify loci contributing to disease susceptibility in an IBD population from Canada and to compare their results in a systematic manner with those of previously published IBD data sets. The authors performed genome-wide linkage analysis on 63 IBD families from Nova Scotia, Canada. They then undertook a meta-analysis to combine the results of their study with those of the four previously published IBD genome-wide scans with complete data reported. Their genome-wide scan identified three regions of suggestive linkage to IBD: 11p, and The locus on chromosome 11p has not been previously reported. Meta-analysis of multiple scans revealed linked regions corresponding to the, and loci. Meta-analysis of linkage data is a powerful approach for identifying and confirming common susceptibility loci and specifically shows that, and are the major, common IBD susceptibility loci in the populations studied thus far.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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