Enhanced Binding of TonB to a Ligand-loaded Outer Membrane Receptor
Notice bibliographique
Résumé
The ferric hydroxymate uptake (FhuA) receptor from Escherichia coli facilitates transport of siderophores ferricrocin and ferrichrome and siderophore-antibiotic conjugates such as albomycin and rifamycin CGP 4832. FhuA is also the receptor for phages T5, T1, Phi80, UC-1, for colicin M and for the antimicrobial peptide microcin MccJ21. Energy for transport is provided by the cytoplasmic membrane complex TonB.ExbB.ExbD, which uses the proton motive force of the cytoplasmic membrane to transduce energy to the outer membrane. To accomplish energy transfer, TonB contacts outer membrane receptors. However, the stoichiometry of TonB. receptor complexes and their sites of interaction remain uncertain. In this study, analyses of FhuA interactions with two recombinant TonB proteins by analytical ultracentrifugation revealed that TonB forms a 2:1 complex with FhuA. The presence of the FhuA-specific ligand ferricrocin enhanced the amounts of complex but is not essential for its formation. Surface plasmon resonance experiments demonstrated that FhuA.TonB interactions are multiple and have apparent affinities in the nanomolar range. TonB also possesses two distinct binding regions: one in the C terminus of the protein, for which binding to FhuA is ferricrocin-independent, and a higher affinity region outside the C terminus, for which ferricrocin enhances interactions with FhuA. Together these experiments establish that FhuA.TonB interactions are more intricate than originally predicted, that the TonB.FhuA stoichiometry is 2:1, and that ferricrocin modulates binding of FhuA to TonB at regions outside the C-terminal domain of TonB.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».