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Enregistrement W1999736395 · doi:10.1021/tx900268r

Generation of 2′-Deoxyadenosine <i>N</i><sup>6</sup>-Aminyl Radicals from the Photolysis of Phenylhydrazone Derivatives

2009· article· en· W1999736395 sur OpenAlexafffund
Vandana Kuttappan-Nair, François Samson-Thibault, J. Richard Wagner

Notice bibliographique

RevueChemical Research in Toxicology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueRadical Photochemical Reactions
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRadicalChemistryDeoxyadenosinePhotochemistryDeaminationHydrazonePhotodissociationMoietyMedicinal chemistryStereochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitrogen-centered radicals are major species generated by the addition of hydroxyl radicals and the one-electron oxidation of adenine derivatives. Aminyl radicals are also generated in the decomposition of adenine chloramines upon reaction of hypochlorite. Here, we report the photochemistry of modified 2'-deoxyadenosine (dAdo) containing photoactive hydrazone substituents as a model to investigate the chemistry of dAdo N(6)-aminyl radicals. Derivatives of dAdo containing a phenylhydrazone moiety at N6 displayed UV absorption between 300 and 400 nm. Upon UV photolysis in the presence of a H-donor, that is, glutathione, two major products were formed, dAdo and benzaldehyde, indicating efficient homolytic cleavage to dAdo N(6)-aminyl radicals and benzylidene iminyl radicals. dAdo N(6)-phenylhydrazone was photolyzed in the presence of a molar excess of nonmodified dAdo to mimic the reactions taking place in DNA, and the major photoproducts were identified by high-performance liquid chromatography, mass spectrometry, and nuclear magnetic resonance. The formation of 2-(benzylideneamino)-2'-deoxyadenosine as well as a more extensive oxidation product may be explained by the recombination of initial dAdo N(6)-aminyl and benzylidene iminyl radicals. The formation of 2'-deoxyinosine may be explained by hydrolytic deamination of dAdo N(6)-aminyl radicals. Interestingly, a dimeric product containing two dAdo moieties was identified in the photolysis mixture. The present studies demonstrate the ability of dAdo N(6)-aminyl radicals to undergo H-abstraction to give dAdo, deamination to give 2'-deoxyinosine, and addition to the adenine moiety to give dimers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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