MUF1, A Novel Elongin BC-interacting Leucine-rich Repeat Protein That Can Assemble with Cul5 and Rbx1 to Reconstitute a Ubiquitin Ligase
Notice bibliographique
Résumé
The heterodimeric Elongin BC complex has been shown to interact in vitro and in mammalian cells with a conserved BC-box motif found in a growing number of proteins including RNA polymerase II elongation factor Elongin A, SOCS-box proteins, and the von Hippel-Lindau (VHL) tumor suppressor protein. Recently, the VHL-Elongin BC complex was found to interact with a module composed of Cullin family member Cul2 and RING-H2 finger protein Rbx1 to reconstitute a novel E3 ubiquitin ligase that activates ubiquitylation by the E2 ubiquitin-conjugating enzymes Ubc5 and Cdc34. In the context of the VHL ubiquitin ligase, Elongin BC functions as an adaptor that links the VHL protein to the Cul2/Rbx1 module, raising the possibility that the Elongin BC complex could function as an integral component of a larger family of E3 ubiquitin ligases by linking alternative BC-box proteins to Cullin/Rbx1 modules. In this report, we describe identification and purification from rat liver of a novel leucine-rich repeat-containing BC-box protein, MUF1, which we demonstrate is capable of assembling with a Cullin/Rbx1 module containing the Cullin family member Cul5 to reconstitute ubiquitin ligase activity. In addition, we show that the additional BC-box proteins Elongin A, SOCS1, and WSB1 are also capable of assembling with the Cul5/Rbx1 module to reconstitute potential ubiquitin ligases. Taken together, our findings identify MUF1 as a new member of the BC-box family of proteins, and they predict the existence of a larger family of Elongin BC-based E3 ubiquitin ligases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».