IDA-1, aCaenorhabditis elegans homolog of the diabetic autoantigens IA-2 and phogrin, is expressed in peptidergic neurons in the worm
Notice bibliographique
Résumé
The closely related mammalian proteins IA-2 and phogrin are protein tyrosine phosphatase-like receptor proteins spanning the membrane of dense core vesicles of neuroendocrine tissues. They are of interest as molecular components of the secretory machinery and as major targets of autoimmunity in type I diabetes mellitus. The Caenorhabditis elegans genome has a single copy of an IA-2/phogrin homolog ida-1 III (islet cell diabetic autoantigen), which encodes the ida-1 (B0244.2) gene product as a series of 12 exons over a 10-kb region of chromosome III. The full-length sequence of the ida-1 cDNA encoded a 767-amino acid type 1 transmembrane protein of 87 kDa. The PTP catalytic site consensus sequence of IDA-1, like IA-2 and phogrin, diverged and would not be active. Expression of green fluorescent protein (GFP) under the ida-1 gene promoter showed activity in a subset of around 30 neurons with sensory functions and the uv1 cells of the vulva in hermaphrodites. Males showed additional expression in male-specific neurons. In situ experiments in rat brain showing the distribution of IA-2 and phogrin suggested a complimentary and overlapping pattern compared with the proprotein convertases PC1 and PC2. In C. elegans, IDA-1-expressing cells comprised a subset of those expressing the PC2 homolog KPC-2 (C51E3. 7), consistent with IDA-1 being a component of neuropeptide-containing dense core vesicles. The results support the hypothesis that C. elegans IDA-1 is the functional homolog of IA-2 and phogrin in mammals. Analysis of the function of IDA-1 should contribute to our understanding of the function of these proteins in signal transduction, vesicle locomotion, and exocytosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».