Role of the Tetradecapeptide Repeat Domain of Human Histone Deacetylase 6 in Cytoplasmic Retention
Notice bibliographique
Résumé
Histone deacetylase 6 (HDAC6) contains tandem catalytic domains and a ubiquitin-binding zinc finger and displays deacetylase activity toward acetylated microtubules. Here we show that unlike its orthologs from Caenorhabditis elegans, Drosophila, and mouse, human HDAC6 possesses a tetradecapeptide repeat domain located between the second deacetylase domain and the C-terminal ubiquitin-binding motif. Related to this structural difference, the cytoplasmic localization of human, but not murine, HDAC6 is resistant to treatment with leptomycin B (LMB). Although it is dispensable for the deacetylase and ubiquitin binding activities of human HDAC6, the tetradecapeptide repeat domain displays acetyl-microtubule targeting ability. Moreover, it forms a unique structure and is required for the LMB-resistant cytoplasmic localization of human HDAC6. Besides the tetradecapeptide repeat domain, human HDAC6 possesses two LMB-sensitive nuclear export signals and a nuclear localization signal. These results thus indicate that the cytoplasmic localization for murine and human HDAC6 proteins is differentially regulated and suggest that the tetradecapeptide repeat domain serves as an important sequence element to stably retain human HDAC6 in the cytoplasm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».