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Enregistrement W1999955396 · doi:10.4161/isl.3.4.15881

Kinetics and genomic profiling of adult human and mouse β-cell maturation

2011· article· en· W1999955396 sur OpenAlexfundno aff
Marta Szabat, Poya Pourghaderi, Galina Soukhatcheva, C. Bruce Verchere, Garth L. Warnock, James M. Piret, James D. Johnson

Notice bibliographique

RevueIslets · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPDX1BiologyCell biologyIsletProgenitor cellGene expression profilingCellular differentiationCellHumanized mouseStem cellIn vivoGene expressionMolecular biologyInsulinGeneEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diabetes is a multifactorial metabolic disorder defined by the loss of functional pancreatic insulin-producing β-cells. The functional maturation and dedifferentiation of adult β-cells is central to diabetes pathogenesis and to β-cell replacement therapy for the treatment of diabetes. Despite its importance, the dynamics and mechanisms of adult β-cell maturation remain poorly understood. Using a novel Pdx1/Ins1 dual fluorescent reporter lentiviral vector, we previously found that individual adult human and mouse β-cells exist in at least two differentiation states distinguishable by the activation of the rat Ins1 promoter and performed the first real-time imaging of the maturation of individual cultured β-cells. Our previous study focused on transformed (MIN6) β-cells as a model to investigatethe kinetics of β-cell maturation. In the present study, we investigated the kinetics of the maturation process in primary human and mouse β-cells and performed gene expression profiling. Gene expression profiling of FACS purified immature Pdx1 (+) /Ins1 (low) cells and mature Pdx1 (high) /Ins1 (high ) cells from cultures of human islets, mouse islets and MIN6 cells revealed that Pdx1 (+) /Ins1 (low) cells are enriched for multiple genes associated with β-cell development/progenitor cells, proliferation, apoptosis, as well as genes coding for other islet cell hormones such as glucagon. We also demonstrated that the heterogeneity in β-cell maturation states previously observed in vitro, can also be found in vivo. Collectively, these experiments contribute to the understanding of maturation, dedifferentiation and plasticity of adult pancreatic β-cells. The results have significant implications for islet regeneration and for in vitro generation of functional β-cells to treat diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,155

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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